包莖手術后恢復過程可分為出血期、水腫期和瘢痕期。出血期通常在手術前幾天，由于包皮切割和縫合，傷口尚未愈合，陰莖勃起或受到擠壓時可能會出現出血。在傷口換藥時，由于傷口與包扎的紗布粘連，也可能導致出血。此時期應規范無菌操作及消毒，容易發生傷口感染。水腫期與出血期同時存在，但比出血期持續時間長，由于手術造成包皮血管和組織離斷，組織滲出導致水腫。
多數在術后2周時慢慢消退，但也有比較嚴重的水腫，可持續數月。為避免術后水腫加重，可使用彈力繃帶進行局部加壓包扎。瘢痕期屬于包莖手術恢復的后期，傷口基本愈合，一少部分可能還合并有水腫情況，已經不影響正常生活，此時瘢痕基本形成，瘢痕剛形成時可能比較硬，但多數隨時間慢慢軟化，對陰莖功能沒有影響。