治療肛瘺需要通過肛瘺切開掛線術，手術過程一般是在保護肛門括約肌功能的前提下盡量將瘺管壁以及內口外口處理干凈。手術中肛門局部形成皮筋的掛線，術后隨著皮筋的脫落，表明局部括約肌間斷性的切割。皮筋脫落以后表明局部傷口基本恢復，還需要后期生長肉芽。