兩者感染原因不同。
胃腸感冒主要由柯薩奇病毒引起，伴有細菌混合感染。主要臨床癥狀為：腹脹、腹痛、嘔吐、腹瀉、一天排便頻繁、乏力、嚴重脫水、電解質紊亂、免疫系統破壞。胃腸感冒要先治療，感冒的癥狀會減輕，胃腸道的癥狀也會減輕。如果只治療腹瀉，并不會緩解和延緩病情。普通腸胃炎是由細菌感染引起的簡單胃腸道癥狀。輕度者可口服抗生素，嚴重脫水者可靜脈滴注。
腸胃炎需用抗生素治療，平時一定要多運動，吃平淡飲食進行調節身體。