口腔上顎潰瘍的發生與多種因素有關，包括但不限于飲食不當、局部損傷、營養缺乏、機體免疫力下降以及病毒感染等，因此在治療過程中，必須先查明病因，然后采取一般治療、營養治療和免疫治療等綜合措施。對于持續不緩解的潰瘍，建議患者及時就醫，并在醫生的指導下進行處理。
針對口腔上顎黏膜損傷所致的潰瘍，通常采用含有消炎成分的含漱液、含片等藥物進行治療，如氯己定含漱液、復方硼砂含漱液、西地碘含片、地喹氯銨含片等，同時也可以使用西瓜霜噴劑、草珊瑚口腔噴霧劑等，以促進癥狀的改善；
針對口腔潰瘍因營養缺乏而引起的問題，可考慮補充維生素B、維生素C以及微量元素，以促進口腔黏膜的修復和潰瘍癥狀的改善。