一般情況下，小兒鞍上生殖細胞瘤要做頭顱CT檢查、腫瘤標志物檢查等檢查：
1、頭顱CT檢查：小兒鞍上生殖細胞瘤極少有鈣化出現，多為實質腫物，頭顱CT檢查故對小兒鞍上生殖細胞瘤的診斷有一定價值。
2、腫瘤標志物檢查：腫瘤標志物檢查主要是通過腦室穿刺得到的腦脊液測定腫瘤標志物，比如甲胎蛋白、癌胚抗原等，陽性說明存在生殖細胞腫瘤的可能性。