臨床上認為與遺傳因素，家庭因素，環境因素，社會因素，以及出生前后的缺血缺氧性腦損傷等綜合因素有關。遺傳因素，在孤獨癥的發病中，占的比例比較高。有孤獨癥患者的家庭比沒有孤獨癥患者家庭發病的幾率也高，同時單卵雙胎引起的孤獨癥發病率較，其他的家庭也高。家庭的教育方式，以及父母的文化程度，在孤獨癥的發病當中，也占有一定的比例。