新生兒吞咽障礙是否能自愈需要根據原因以及嚴重程度來判斷。對于發育未完全的輕度新生兒吞咽障礙，一般可以自愈。如果是疾病導致的重度吞咽障礙，則可能無法達到自愈的目的，建議此類家長及時帶新生兒就醫明確原因，以免延誤病情。
如果只是輕微的吞咽障礙，可能是吞咽功能未發育完全導致的，如果沒有伴隨其他不適癥狀，一般通過吞咽訓練的方法能夠改善，比如將奶嘴或乳頭放在新生兒口中，家長用手指揉捏奶嘴或乳頭，讓奶粉或乳汁進入新生兒口中，進而刺激新生兒進行吞咽，另外在平時還要注意喂養方式，避免過急或者過多進食，通常是可以自愈。
但如果新生兒出現了嚴重的吞咽困難情況，可能是咽喉發育異常、扁桃體炎等原因導致的，此時通常無法自愈。家長需要及時帶新生兒就醫針對病因進行治療，同時可以在醫生指導下使用胃管將營養物質注入體內，從而維持機體正常運轉。
此外，在日常生活中，家長要注意加強對新生兒的看護，認真觀察新生兒的呼吸情況以及體溫情況，若有異常應及時告知醫生。