孩子擤鼻涕和晃腦袋時說頭頂部疼出現這種情況可能是感冒、鼻竇炎、腦炎疾病引起，需要積極的到醫院做檢查，查明原因，然后針對性治療。
1、感冒：
感冒是日常生活中常見疾病，大部分的感冒是由病毒引起，當病毒在體內大量繁殖，患者就會出現流鼻涕和打噴嚏癥狀，如果病毒的致病能力比較強，患者在擤鼻涕和晃腦袋時就會出現頭部疼痛，需要遵醫囑口服利巴韋林或者頭孢克肟藥物進行治療。
2、鼻竇炎：
孩子擤鼻涕和晃腦袋時說頭頂疼痛主要是由于鼻竇炎疾病造成，一旦發病患者的鼻竇腔內就會出現膿性分泌物，細菌毒素和黏膜腫脹刺激就會壓迫到局部的末梢神經組織，患者就會出現以上癥狀，可以口服布洛芬膠囊或者丙酸氟替卡松鼻噴劑等藥物進行治療。
3、腦炎：
腦炎主要是由于炎癥對顱腦進行損害造成的一種疾病，當患者的腦脊液循環出現不暢時，容易引起顱內粘連，患者就會伴隨著頭痛，特別是在擤鼻涕和晃腦袋時，頭頂會出現劇烈性疼痛癥狀，可以使用阿昔洛韋或者頭孢曲松藥物治療，也可以配合谷維素片藥物治療。