通常情況下，月經期間不可以用激光治療扁平疣，此時可能會降低激光治療的安全性，給身體帶來不良影響，建議月經期結束之后再用激光治療扁平疣。
在月經期間，女性身體免疫力通常會比較弱，用激光治療扁平疣后，稍有護理不當就會增加感染的幾率，因此在月經期間通常不可以用激光治療扁平疣。另外，用激光治療扁平疣通常是利用激光瞬間產出的脈沖和能量，對扁平疣的部位進行刺激和損傷，會對皮膚造成一定損傷，在月經期間女性身體的抗凝能力較弱，此時用激光治療扁平疣，也可能會增加術中出血的風險，因此女性在月經期間通常不可以用激光治療扁平疣。在有用激光治療扁平疣的需求時，通常可以在月經期結束后三天后就醫，必要時根據醫生指導用激光治療扁平疣。
月經期間女性通常需要注意休息，做好各方面的保暖工作，不要吃辛辣、生冷的食物，也盡量避免接觸涼水，良好的護理有助于身體健康。用激光治療扁平疣以后，要做好激光部位的衛生護理，不可以胡亂抓撓或者揉搓，也要避免短期內碰水，以免出現繼發性感染。