射完小便時尿道刺痛的原因有很多，常見于性生活影響、泌尿生殖系統感染、尿道結石。出現尿道刺痛的癥狀，需要及時前往醫院就診，避免病情進一步加重。
1、性生活影響：性生活時間過長會導致尿道口反復摩擦，動作幅度較大會導致尿道局部的軟組織損傷，甚至使用劣質避孕套，其化學成分刺激，都可能會導致此種情況；
2、泌尿生殖系統感染：出現泌尿生殖系統感染時，也可能出現射完小便時尿道刺痛，如尿道炎、膀胱炎、前列腺炎、精囊炎等疾病。排尿時由于炎癥刺激、尿道黏膜損傷，會導致尿道刺痛，還可伴隨出現尿頻、尿急等癥狀；
3、尿道結石：當患者出現尿道結石時，排尿受到阻礙，尿流沖刷引起結石發生移動，對尿道的黏膜造成刺激，從而引起射完小便時尿道刺痛的發生。
但單純依靠射完小便時尿道刺痛這一個癥狀，并不能準確判斷是何種疾病，需要及時到醫院完善相關檢查明確病因，然后進行相應治療。若是性生活導致，休息后刺痛癥狀可以得到緩解。若是感染引起，需要通過血常規、細菌培養等檢查，明確感染類型，選用敏感抗生素進行治療，如左氧氟沙星、環丙沙星等藥物。若為尿道結石引起，需要通過超聲、CT等相關檢查，明確結石大小及位置，并進行相應治療。