骶骨脊索瘤通常較難徹底治愈，后期復發的概率比較大，并不能通過手術的方法完全清除腫瘤。注意定期進行復查，要根據病情的嚴重程度，針對性地選擇治療方案。
骶骨脊索瘤是先天因素引發的腫瘤，主要由于先天脊索殘余組織沒有完全退化，后期出現局部細胞異常分裂增殖，從而形成腫瘤。骶骨脊索腫瘤生長的速度相對比較快，容易破壞周圍的骨質，需要盡快通過手術的方法切除腫瘤處理。由于手術通常并不能完全清除，可能達不到徹底治愈的效果，后期復發的概率比較大，所以可能無法徹底治愈。手術治療之后，需要注意定期進行復查，可以聯合放化療的方法做進一步的治療，盡可能殺滅殘留的腫瘤細胞，延緩和控制病情的發展。
如果骶骨脊索瘤侵犯周圍神經組織，可能影響大小便功能，以及性功能，需要后期應用營養神經的藥物做進一步的治療，比如注射用單唾液酸四己糖神經節苷脂鈉，促進神經功能的恢復，提高患者的生活質量。在治療恢復的過程當中，需要注意飲食營養的補充，適當地多吃維生素，以及蛋白質含量比較豐富的食物。