屋里熏艾葉的副作用是艾葉在燃燒過程中會產生CO（一氧化碳）等有毒有害的物質，長期吸入后不利于個人的健康；禁忌為禁止靠近易燃物、操作時禁止開窗、操作完畢及時通風等。
熏艾葉，將其點燃進行火熏，利用其藥理作用，在夏季悶熱潮濕時使用，以防病菌病毒滋生，常用在室內熏艾從而起到殺滅病菌作用。而使用的原料艾蒿，具有消毒殺蟲，解毒祛濕的作用，同時具有特殊的芳香，因此其抗菌、助睡眠、除異味效果較好顯著。
房間熏艾葉的副作用是艾葉在燃燒過程中會產生CO（一氧化碳）等有毒有害的物質，長期吸入后不利于個人的健康，出現頭暈腦脹、喉嚨不適等癥狀。
在進行艾熏操作時，因其有燃燒的過程，故應遠離易燃物，防止火災形成；在進行操作時應關閉門窗，使其煙霧充分填滿房間；同時在操作進行完畢后，應及時開窗通風，防止其煙霧在房間內留存。
建議患者不必過度緊張焦慮，遵醫囑規范熏艾葉，避免因不當操作導致出現不良影響。