甲亢、甲減一般指甲狀腺功能亢進癥、甲狀腺功能減退。甲狀腺功能亢進癥的患者吃甲巰咪唑變成甲狀腺功能減退，需要針對原因進行處理，常見的原因包括藥物影響、一過性甲狀腺功能減退、合并橋本甲狀腺炎等。
1、藥物影響：如果甲狀腺功能亢進癥患者吃甲巰咪唑時間過長，或者是用量過大，可能會導致甲狀腺激素和三碘甲狀腺原氨酸過度減少，引起甲狀腺功能減退。此時需要及時就醫，可遵醫囑調整用藥時間，或者是調整用藥劑量，合理控制甲狀腺激素水平。
2、一過性甲狀腺功能減退：患有急性甲狀腺炎、亞急性甲狀腺炎的情況下，甲狀腺上皮細胞被細菌、病毒破壞，可導致甲狀腺激素釋放入血，出現甲狀腺功能亢進癥，隨著甲狀腺激素進一步降低，隨后可能變成一過性甲狀腺功能減退。大多數患者可自行恢復，一般不需要特殊治療。
3、合并橋本甲狀腺炎：甲狀腺功能亢進癥患者如果同時合并橋本甲狀腺炎，當遵醫囑服用甲巰咪唑好轉以后，原來的橋本甲狀腺炎引起的甲狀腺功能減退癥狀可能會逐漸顯現出來。此時應該遵醫囑使用左甲狀腺素鈉片，適當補充甲狀腺激素。
平時需要遵醫囑使用藥物，規范進行治療。