長期應用糖皮質激素不良反應有感染、代謝紊亂、消化道出血等，建議合理使用藥物。
1、感染：糖皮質激素是機體內極為重要的一類調節分子，對于身體的發育、生長、代謝以及免疫功能等起著重要調節作用，臨床上是一種有效的抗炎和免疫抑制劑。若是長期使用，可能因免疫抑制導致機體免疫力下降，容易導致身體內外感染因素擴散，導致患者出現明顯的感染癥狀。
2、代謝紊亂：作為激素類藥物，其本身對于人體的生長發育以及內分泌有著較為明顯的影響。若是患者長期使用，通常會導致患者出現不同程度的代謝紊亂，出現痤瘡、肥胖、水腫等現象，還能影響鈣質代謝，誘發骨質疏松的現象。
3、消化道出血：激素類藥物，通常對于消化道有一定的刺激性。若是患者使用不當，容易導致消化道損傷，此時局部黏膜防御力下降，易因外界損傷，導致出現破潰出血的現象，還可能會影響消化功能，出現腹痛、反酸、惡心等癥狀。
除此之外，心腦血管損傷也是長期應用該藥物可能會出現不良反應。所以，為身體健康著想，建議患者在醫生指導下合理地用藥，降低上述不良反應出現的概率。