間歇性斜視手術是二級中等手術，存在一定的風險，不可輕視。建議謹遵醫囑，做好術前準備以及各項檢查，術后定期換藥等預防感染，可幫助降低手術風險。
1、矯正不佳：若矯正不佳，則無法緩解間歇性斜視的相關癥狀，無法達到預期的手術效果，甚至可能引起恒定性斜視；
2、傷口開裂、出血：如手術縫合后有結膜切口的開裂，可能需要進行二次處理，從而增加患者的痛苦。而部分患者術后傷口可能會出現滲血等癥狀，從而導致視力模糊甚至下降；
3、損傷鞏膜：較為少見，若部分患者是高度近視或者鞏膜先天較薄，做這種手術時，可能會損傷甚至穿透鞏膜，從而引起較為嚴重的損傷；
4、局部感染：較為多見，通常因為術后局部存在污染，或者流淚，眼睛分泌物刺激傷口等，均可以誘發局部出現感染，感染了可能會影響手術的效果，甚至導致手術失敗。