一般情況下，可以先吃健脾散再吃益生菌，也可以先吃益生菌再吃健脾散，兩種藥物的服用順序沒有具體的要求。如果出現脾胃不和或消化不良的現象，出現腹部疼痛、腹瀉以及腹脹等表現，可以在醫生的指導下服用健脾散以及益生菌進行改善。
健脾散屬于中藥，具有健脾、消食以及止瀉的功效，能夠調理脾胃，可用于治療消化不良，服用以后有助于增強胃腸蠕動，促進腸道的消化吸收。益生菌屬于西藥，服用益生菌以后，有助于調理腸道菌群失衡，也可以促進腸胃蠕動，使身體不適的情況得到改善。但建議兩者分開服用，避免藥效發生相互作用，以免對病情的恢復造成影響。
可以先服用其中一種藥物，再服用另外一種藥物，兩者服用時間間隔半小時至一小時，以防止藥物之間發生相互作用，減少藥物在身體內發生不良反應的幾率。在服用藥物的時候需謹遵醫囑，不可以自行盲目用藥，以免服用藥物不當而影響身體健康，不利于疾病的恢復。