幽門螺旋桿菌一般指幽門螺桿菌。幽門螺桿菌感染的主流治療是采用四聯藥物聯合方案，而幽門螺桿菌二聯用藥方案主要是選用一種高效的質子泵抑制劑，一般指雷貝拉唑或艾司奧美拉唑，另一種則是抗生素，如阿莫西林。使用大劑量二聯藥物根除方案，幽門螺桿菌根除率也可以達到90%以上。但是，幽門螺桿菌二聯用藥仍處在臨床研究階段，暫未能作為一二線主流的根除方案進行推薦。如果未經過專科醫生的指導，不建議盲目使用二聯方案進行治療。
臨床主要采用幽門螺桿菌四聯藥物方案進行治療，一般是選用一種質子泵抑制劑，一種鉍劑，以及兩種抗生素。質子泵抑制劑就是通常所說的拉唑類藥物，常見有奧美拉唑、蘭索拉唑、雷貝拉唑、艾司奧美拉唑等，鉍劑常見的包括枸櫞酸鉍鉀、膠體果膠鉍、復方鋁酸鉍等，抗生素包括阿莫西林、克拉霉素、左氧氟沙星、四環素、甲硝唑等。具體選用何種藥物通常需根據患者肝腎功能情況、平日用藥情況、當地抗生素的耐藥率，以及藥物的可獲得性等進行綜合決定。