藥物流產時首先妊娠產物從宮腔排出到陰道中，然后再從陰道排出體外。從服用藥物第三天開始到妊娠產物排出體外，大約需要2-6個小時。
藥物流產時可服用米非司酮片，兩天后使胚胎停止發育，第三天再服用米索前列醇片可以促進子宮收縮，已經停止發育的妊娠囊從宮腔內排入陰道中。有些陰道比較松弛的女性，妊娠囊從宮腔排出陰道后馬上就從陰道排出體外，但有部分女性陰道相對比較緊，妊娠囊被夾在陰道中并不會自己排出，需要醫生用窺器打開陰道，看到妊娠囊在陰道中后而取出妊娠囊。所以若長時間看不到妊娠產物排出體外，可讓醫生進行檢查，并且把妊娠囊鉗出體外。
如果在等待妊娠產物排出期間陰道流血量大于150毫升，建議盡快做清宮手術，以免導致失血性休克。妊娠產物排出體外后并不代表完全干凈，宮內可能會有殘留，建議7-10天進行復查。