破血逐瘀和活血化瘀的區別，主要在療效方面，二者都是用動物類、蟲類和草木類的藥物，祛除停留在經絡臟腑之間的瘀血，但二者化瘀的力量不同。
破血化瘀是中醫對血瘀證的治療方法，是一種化血瘀中的猛烈藥劑。久病血瘀過重，瘀血一般是干血、死血，通常的藥物不能解決問題，須用蟲蟻類的藥物，以及血肉有情之物，才有息風化痰、破血逐瘀的功效。破血逐瘀比活血化瘀的力量更強，對體內腫瘤或者包塊等，也有一定的輔助治療的作用。破血逐瘀的代表藥物有全蝎、蜈蚣、水蛭等。而活血化瘀的力量相對微弱，對體內的血瘀可以起到消散作用，代表藥物有當歸、川芎、丹參、紅花等。
因此，雖然同為祛瘀，但破血逐瘀偏重蟲蟻類的藥物，祛瘀效果更強烈。而活血化瘀偏草木類的藥物，化瘀的力量比較輕。