穿紙尿褲起紅疙瘩可能是過敏、尿布皮炎、毛囊炎等疾病導致，可以使用藥物進行治療。
1.過敏：如果嬰兒對紙尿褲中含有的化學成分有過敏反應，則容易出現紅色丘疹、紅斑等過敏癥狀，以及瘙癢、刺痛、干燥等癥狀。父母可以聽從醫生的建議，給嬰兒口服抗過敏藥物，如氯雷他定顆粒、鹽酸左西替利嗪顆粒、西替利嗪片，緩解過敏的癥狀。
2.尿布皮炎：由于尿液和糞便對尿布區域的長期刺激，皮膚表面和尿液中的細菌分解尿素，產生大量胺刺激皮膚，引起尿布皮炎。家長需要在醫生的指導下對嬰兒使用復方糖皮質激素乳膏進行治療，如曲安奈德益康唑乳膏、丁酸氫化可的松乳膏、糠酸莫米松乳膏等，可以抑制炎癥。
3.毛囊炎：穿紙尿褲，由于天氣炎熱，經常出汗，也可能導致汗液堵塞毛孔，引起毛囊炎。如果癥狀嚴重，可以遵醫囑使用相應的抗生素進行改善，如紅霉素軟膏、夫西地酸乳膏、莫匹羅星乳膏等抑制細菌的生成和繁殖。
除以上原因外，還可能是濕疹、蕁麻疹、疥瘡、特應性皮炎等，建議家長及時帶嬰兒前往醫院治療。