頭MRA平掃與腦磁共振均是用于腦血管病的檢查，均屬于核磁共振的檢查范疇，但是檢查的部位不一樣。兩者既有一定的區別，也有一定的聯系，臨床上這兩項檢查均需要進行，以利于明確診斷。
頭MRA平掃主要是做大腦動脈血管的檢查，屬于腦部核磁共振動脈血管成像檢查，可以較清楚地顯示大腦的主干血管是否有較明顯的動脈硬化、斑塊以及狹窄和動脈瘤等情況。頭MRA平掃所顯示的大腦主干血管主要是指雙側頸內動脈、雙側大腦中動脈、左右椎動脈以及基底動脈，還有大腦前循環的大腦動脈環。
而腦核磁共振主要是檢查腦組織，可以較清楚地檢查出腦組織是否有梗死、萎縮、腦白質缺血變性或者是腦出血以及腦部腫瘤占位等重大疾病。尤其是腦梗死，是大腦血管狹窄堵塞所引起的一種疾病，通常需要進行腦核磁共振，并做頭MRA平掃來輔助檢查，以確定病變血管。
頭顱影像檢查的選擇，根據病情以及檢查目的而有所不同，建議患者遵醫囑進行選擇。如果出現頭痛等不適癥狀，一定要及時前往醫院神經內科就診治療，以免延誤病情。