一般情況下，頭發里長了疙瘩，有疼痛感，可能是毛囊炎、皮脂腺囊腫、癤腫等原因引起的，建議根據患者實際情況選擇合適的方法來治療，具體分析如下：
1.毛囊炎：機體抵抗力低下、病原菌感染等原因可能會引起毛囊炎，常伴有膿皰瘡、局部四周有紅暈等癥狀，可能會出現頭發里長了疙瘩，有疼痛感的情況，可在醫生的指導下外用鹽酸環丙沙星凝膠、莫匹羅星軟膏等藥物進行治療。
2.皮脂腺囊腫：皮脂腺排泄管阻塞、痤瘡等原因可能引起皮脂腺囊腫，常伴有囊腫、局部紅腫等癥狀，可能會出現頭發里長了疙瘩，有疼痛感的情況，可在醫生的指導下通過皮脂腺囊腫切除術、二氧化碳激光等方式進行治療。
3.癤腫：貧血、病原菌感染可能引起癤腫，常伴有炎癥丘疹、疼痛等癥狀，可能會出現頭發里長了疙瘩，有疼痛感的情況，可在醫生的指導下服用二丁膠囊、鹽酸克林霉素片等藥物進行治療。