乙類傳染病按甲類管理是指乙類傳染病以甲類管理來控制。主要是傳染性重癥急性呼吸綜合征、炭疽中的肺炭疽、人感染高致病性禽流感以及脊髓灰質炎這四種。
傳染病一般分為甲類、乙類、丙類這三類，其中乙類傳染病包括艾滋病、病毒性肝炎、肺結核、新生兒破傷風、猩紅熱等，通常乙類傳染病可防可控，不屬于烈性傳染病，所以按乙類管理。但是如果出現傳染性重癥急性呼吸綜合征、炭疽中的肺炭疽、人感染高致病性禽流感以及脊髓灰質炎這四種乙類傳染病，則需要按甲類管理來處理。因為這四種乙類傳染病的暴發、流行情況和危害程度都比較強，所以需要按甲類管理來處理。
上述四種乙類傳染病如果暴發，城鎮需要在6小時內，而農村則是需要在12小時內，以最快的通信方式向發病地衛生防疫機構報告。醫療機構需要將病人、病原攜帶者進行隔離治療，而隔離期限應該根據醫學檢查結果來確定，同時疑似病人確診前進行單獨隔離治療；而醫療機構內的病人、病原攜帶者、疑似病人的密切接觸者，也需要進行醫學觀察和其他必要的預防措施。
平時應該避免去人員密集的場所，外出時做好防護措施，定期給住所消毒，身體產生不適時，需及時到醫院診治。