兒童抽動癥一般與食物不耐受之間沒有聯系。兒童抽動癥一般是由于神經生化因素或器質性疾病導致的癥狀，與食物無關，食物不耐受是指對特定食物產生不良癥狀，一般會有腹瀉、腹痛、皮膚丘疹等癥狀。
兒童抽動癥是在兒童階段發生的神經精神障礙性疾病，會有運動和語言方面的癥狀。運動方面兒童會有無規律抽搐、踢腿等動作，語言方面兒童會有不自主地發聲說話、自言自語等癥狀。兒童抽動癥發病的原因與精神壓力過大、腦損傷、身體缺乏微量元素等因素有關，一般與食物不耐受沒有直接關聯。食物不耐受是指兒童對于某種特定食物或食物成分出現不良反應，主要表現在消化系統或皮膚癥狀上，消化系統的不良反應包括腹痛、腹脹、消化不良等癥狀，皮膚不良反應包括皮膚丘疹、皮膚瘙癢等癥狀，與兒童抽動癥沒有明顯關聯。
存在兒童抽動癥的患兒可以在醫生指導下使用氟哌啶醇片、鹽酸硫必利片、氫氯噻嗪可樂定片等藥物，也可以通過心理支持治療、認知治療緩解癥狀。食物不耐受一般不需進行特殊治療，飲食上避開此類食物即可。