甲型流感可能不會影響月經，也有可能會影響月經。
甲型流感是由甲型流感病毒感染引起的急性呼吸道傳染病，主要通過呼吸道飛沫傳播，人群普遍易感，早期通常表現為流感樣癥狀，通常有1~7天的潛伏期。多數患者可能因病毒影響，可出現發熱、頭痛、肌肉酸痛、乏力以及鼻塞、流鼻涕、咽痛等身體不適，但并不會對機體內分泌水平造成影響，疾病不會影響卵巢功能，不會出現月經異常的現象。
如果患者的病情加重，可能會導致自身情緒存在較大的波動，比如比較焦躁、煩悶等，受不良心理因素的影響，可能會影響作息，導致內分泌失調，還可能因患者長期使用抗病毒藥物治療，影響激素水平的穩定性，使得月經不規律，出現異常的提前或延后。
患者可以遵醫囑使用抗病毒藥來抑制病毒的增殖，包括磷酸奧司他韋膠囊、瑪巴洛沙韋片等能抑制甲流病毒的活性，抑制病毒的RNA復制，達到在早期抑制甲型流感病毒自我復制的目的。患者需要及時進行治療，避免延誤治療時間，導致病情加重。