腳大拇指指甲內有污垢、很臭一般與腳部汗液分泌較多、不注意個人衛生等非病理性因素有關，也可能是甲溝炎、甲癬等病理性因素導致的。建議患者根據個人情況，選擇日常調理、使用藥物、手術治療等方式改善。
一、非病理性因素
如果患者腳部汗液分泌較多、不注意個人衛生，不定期洗腳和鞋襪，加上經常穿不透氣的鞋子，可能會導致大量的汗液浸潤到皮膚角質層，污垢在指甲處堆積、滋生細菌，從而出現臭味，一般沒有疼痛不適。平時一定要注意常用溫水泡腳，勤換洗鞋襪，盡量穿透氣的鞋子，可以緩解癥狀。
二、病理性因素
1、甲溝炎：甲溝炎是一種指甲及其周圍的化膿性炎癥，初期患者的癥狀可能不明顯，只有腳大拇指指甲內有污垢、很臭的情況，若局部炎癥反應較明顯，可能伴有熱痛、局部膿性滲出物。患者可以遵醫囑服用抗感染的藥物進行治療，比如阿莫西林膠囊、青霉素v鉀片等；若是膿性滲出物比較多，需要考慮采用甲溝炎切開引流術、甲下積膿拔甲術等方式進行治療。
2、甲癬：甲癬是一種皮膚疾病，主要是真菌侵犯甲板或甲下引起的，容易出現病甲變色、甲周皮膚紅腫等癥狀，也可能會導致腳大拇指指甲內有污垢，而發臭是很典型的癥狀。患者可以遵醫囑外用曲咪新乳膏、鹽酸布替萘芬乳膏等抗真菌的藥物治療；若出現化膿的情況，則需要考慮采用甲下積膿拔甲術拔除病甲。
如果患者出現甲周圍皮膚、甲溝紅腫、化膿等情況，需要及時去正規醫院進行血常規、皮膚真菌鏡檢、X線等檢查，明確情況，平時要加強清潔衛生，保證睡眠充足，增強抵抗力，有利于身體恢復。