阿莫西林不可以治療厭氧菌，建議患者按醫囑合理服用。
阿莫西林的常用劑型有片劑、膠囊劑、顆粒劑、咀嚼片等，是一種β內酰胺類抗生素、青霉素類藥，可以用于上呼吸道感染、皮膚軟組織感染、泌尿生殖道感染、急性單純性淋病等病癥的治療，也可用于治療傷寒、傷寒帶菌者及鉤端螺旋體病；亦可與克拉霉素片、蘭索拉唑腸溶片三聯用藥根除胃、十二指腸幽門螺桿菌，降低消化道潰瘍復發率。厭氧菌是一類在無氧條件下比在有氧環境中生長好的細菌，它能引起人體不同部位的感染，包括闌尾炎、中耳炎、口腔感染、膽囊炎、心內膜炎等。通常阿莫西林不具備殺滅或抑制厭氧菌的功效，無法對其造成的感染進行治療，進而無法感染患者的不適癥狀。
如果患者出現厭氧菌感染的情況，則可以按醫囑服用甲硝唑片、替硝唑片等藥物進行處理，具有較好的抗厭氧菌作用，進而有效改善患者的不適癥狀。
此外，患者用藥期間應該注意合理作息，避免熬夜。用藥期間應該注意合理飲食，避免進食洋蔥、辣椒、大蒜等刺激性較強的食物，以免影響治療效果。