陰囊根部瘙癢有小蟲一般是陰虱病導致的，具體內容分析如下：
陰虱病是由于陰虱叮咬陰部及肛門附近的皮膚而引起的一種寄生蟲病，感染部位一般會出現瘙癢、紅疹、青色瘀斑等癥狀，能看見陰虱蟲，出現陰囊根部瘙癢有小蟲的情況。患者可以先將陰囊部位的陰毛剔除，然后按照醫囑使用克羅米通乳膏、硫軟膏、苯甲酸芐酯搽劑等藥物來治療，平時注意衛生，勤洗澡，治愈前盡量不要同房。