耳朵后面頭發根部長痘痘，多考慮是毛囊炎、皮脂腺囊腫、癤腫等。需明確病因，針對性治療。
1、毛囊炎：
耳朵后面頭發根部長痘痘，可能是毛囊炎。毛囊炎是由毛囊感染細菌或者真菌引起的炎癥，表現為單個或多個紅色丘疹。主要表現為毛囊周圍形成紅色、瘙癢或疼痛的斑點和膿皰，可向外擴散，直至膿皰破裂結痂。
需涂抹莫匹羅星軟膏、夫西地酸等抗生素軟膏；或咪康唑、特比萘芬等抗真菌藥物治療；必要時可進行手術治療引流膿液。
2、皮脂腺囊腫：
皮脂腺囊腫是指皮膚中排泄脂質的腺管阻塞，皮脂排泄不出而堆積在一起形成的囊性腫物。皮脂腺囊腫以皮脂腺管為囊壁，內容物為豆腐渣樣潴留物，是一種緩慢增長的良性病變，累及耳朵后面的頭皮時，可表現為耳朵后面頭發根部長痘痘。
日常需注意耳垂局部的清潔衛生，避免污染創面；外用莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏等藥物抗感染治療；較大的囊腫可以考慮手術切除；然后口服青霉素、頭孢他啶等抗生素抗菌治療。
3、癤腫：
癤腫是由金黃色葡萄球菌或其他致病菌侵入單個毛囊及其周圍組織引起的毛囊局部發生急性化膿性病變。表現為紅色、腫脹、熱和疼痛的小結節，逐漸腫脹，頂部出現黃白色膿頭，通常破裂后有膿液流出，累及耳朵后面的頭皮時，可表現為耳朵后面頭發根部長痘痘。
一般不需要治療，必要時可用青霉素、頭孢他啶等藥物治療；或聯合熱敷、超短波、紅外線等物理治療；還可手術切開引流治療等。
以上藥物均需遵醫囑服用，建議及時就醫，明確病因，針對性治療，以免延誤病情。