癌胚抗原屬于非器官特異性腫瘤相關抗原，癌胚抗原在不同醫療機構中的參考正常值有所差別，但一般
癌胚抗原增高可以發生在直腸癌、胰腺癌及乳腺癌等疾病中，建議患者進行胃腸鏡檢查、乳腺B超、胰腺CT及B超檢查等，觀察這些部位是否存在占位性病變，如果發現病變，需要進一步取病變組織做病理學檢查，才能夠明確診斷。患者還要聯合檢查其他糖蛋白類抗原，如CA125、CA153等綜合分析。
癌胚抗原在部分良性腫瘤及非腫瘤疾病中也可增高，如肝硬化、直腸息肉、潰瘍性結腸炎及乳腺增生等，在臨床上需要注意鑒別。檢驗結果要由臨床專業醫師結合患者的病史、癥狀、體征，以及其他輔助檢查結果進行綜合判斷。檢測中出現癌胚抗原超過30ng/mL的情況，應該積極排查癌癥，在檢查中也有助于發現可能導致癌胚抗原增高的良性疾病，并給予積極治療。良性疾病經過治療好轉之后，癌胚抗原的數值也可以逐漸下降。