木瓜丸的功效主要包括祛風散寒、除濕通絡、活絡止痛，需要遵醫囑服用。
1、祛風散寒：木瓜丸由木瓜、當歸、川芎、白芷、威靈仙、狗脊、牛膝、雞血藤、海風藤、人參、制川烏、制草烏組成，該藥物性溫，可以祛風散寒。
2、除濕通絡：該藥物還可以促進血液循環速度增強，可以幫助濕氣排出，起到除濕通絡的功效。
3、活絡止痛：木瓜丸還可以減弱機體對內外環境刺激的感受性，呈現出活絡止痛的作用，可以用于治療風寒濕閉阻所致的關節疼痛、腫脹、屈伸不利等。
木瓜丸有溫熱之性，容易造成子宮收縮，對孕早期、妊娠晚期或產后婦女可能造成不良影響，應當謹慎使用，預防不良反應的出現。