由于病毒性心肌炎的病因不明，沒有針對性的藥物，所以在早期使用過一些抗菌藥物，但在臨床上并沒有太大的作用。
1.心律失常、心衰：主要是針對癥狀的處理。
2.心肌損傷：可給予輔酶Q10、維生素C等多種具有保護性心肌的藥物。
3.傳導阻滯：如有需要，可加裝心臟起搏裝置。
4.急性期：要多加休息。
5.重癥患者：CCU的監控，方便患者對疾病的快速反應。