通常情況下，跑步是否會使腳拇趾旁邊骨頭突出，需要根據具體情況來判斷，如果適當地跑步，一般不會；但如果長時間或者劇烈地跑步，則有可能會。具體分析如下：
1.不會：跑步是一種比較常見的體育鍛煉，適當的跑步能夠促進局部的血液循環，也能夠促進鈣的吸收，有助于骨骼的生長發育，一般不會危害身體健康，這種情況下跑步通常不會使腳拇趾旁邊骨頭突出。
2.會：患者如果長時間或者劇烈地跑步，則可能會導致腳拇趾關節受到一定的損傷，導致局部的骨頭突出，引發骨刺，還有可能會增加腳拇趾外翻的幾率，這種情況下跑步可能會使腳拇趾旁邊骨頭突出，還可能會伴有疼痛、紅腫等不適癥狀。