免疫組化檢查應用較為廣泛，約90%-95%的惡性腫瘤通過免疫組化檢查可獲得明確診斷，建議免疫組化進一步檢查就是為了區別具體病理類型，明確診斷與鑒別診斷，判斷病變的性質及來源，還可以指導治療方案的制定。
腫瘤細胞的分化各異，有高、中、低、未分化之分，分化程度差的腫瘤細胞有時難以辨別具體病理類型，或存在原發部位不明確的情況，如小細胞癌與淋巴瘤。免疫組化檢查的基本原理是抗原與抗體結合后產生的特異反應，惡性腫瘤在細胞代謝及腫瘤生長過程中會產生特定的抗原物質，利用試驗獲取的抗體使抗原與抗體結合，產生高度特異性，可判斷腫瘤的性質及原發部位。
免疫組化檢查是臨床上經常使用的一種檢測方法，是一種相對比較好的檢測方式，主要應用于腫瘤的診斷、鑒別診斷以及甲狀腺功能、性腺功能等相關檢測。此外，胸水、腹水的檢測也可以用到免疫組化檢查。乳腺癌患者進行免疫組化檢查可以輔助進一步治療。