先天性腦發育不良不能治好，此病可經治療后有機會緩解，但無法完全治愈。
患者可能是由于父母近親結婚、存在家族遺傳因素、21-三體綜合征、18-三體綜合征、患者母親高齡引起，還可能是患者母親在懷孕、生產過程前后受致畸物質因素導致。先天性腦發育不良的治療極為困難，目前臨床治療效果仍未有突破性進展，醫生會給患者使用一些改善腦代謝的藥物進行治療，比如奧拉西坦膠囊、胞磷膽堿鈉片等，輔以針灸、按摩這些方式來配合患者進行治療，盡量讓患者的其他腦細胞能代償損失的大腦細胞功能，以此改善病情。
建議大家做好早期防范，比如避免近親婚配，妊娠年齡不可過大或過小，存在精神病家族史、腦發育遲緩綜合征的患者需要做好節育措施，孕婦要做好產前檢查、孕期保健，全家一起預防可能影響腦發育的產前、產時及產后的各種不良因素。