腎上腺囊腫惡性腫瘤手術為大手術，風險較大，而良性腫瘤手術一般不屬于大手術，治療方式一般采用腹腔鏡手術，風險較小。在術后可通過飲食促進傷口恢復，多吃豐富蛋白質類和水果蔬菜類食物，禁食辛辣刺激性食物。
腎上腺囊腫可分為良性和惡性，良性腎上腺囊腫，通常是運用腹腔鏡手術，風險較小；惡性腫瘤與周圍器官關系密切，此類手術風險高，屬于重大手術。腹腔鏡手術是外科醫生在體外通過插入鏡頭和手術器械進行的手術。手術創傷小，腹部切口瘢痕小，術后并發癥少，術后恢復快。
腎上腺囊腫在病理上分為腎上腺皮質腺瘤、腎上腺皮質腺癌和腎上腺髓質腫瘤，腎上腺皮質腺瘤在簡單切除后有望完全恢復。當腺瘤以外的腺體出現結節性改變時，應切除腎上腺的這一側。單側原發性腎上腺皮質增生可用同側腎上腺切除術或腎上腺次全切除術治療，腎上腺皮質癌和異位醛固酮產生腫瘤的原發病灶應盡可能切除。
腎上腺切除術是在全身麻醉下以健康的側臥位進行的，然后清理腹膜外脂肪，切下鰓筋膜，尋找腎上極的腎上腺。發現腎上腺后，腎上腺主要位于腎臟上極內側。小心地將腎上腺與周圍組織分開，并結扎中央靜脈，以便發現并切除腎上腺。
腎上腺囊腫手術后應通過飲食促進傷口的恢復，應該補充更多的蛋白質，如瘦肉、魚、雞肉等。應該少吃辛辣和油膩的食物和海鮮、蝦、無鱗魚等食物。可以多吃蔬菜和水果，保持大便通暢，避免腹壓增加。