通常情況下，甲型流感后頭疼是否是腦炎，需根據具體情況而定。甲型流感是由甲型流感病毒引起的急性呼吸道傳染病，如身體不適，建議及時就醫。
1、是：如果患者的病情嚴重，出現發熱、劇烈頭痛、肌肉酸痛等癥狀，此時病毒和代謝產物，可能會通過血腦屏障進入腦部，可能是腦炎。
2、不是：如果患者的病情較輕，如咽干、咳嗽、喉嚨痛等，或者是偏頭痛、緊張性頭痛、高血壓等原因引起的頭疼，通常不是腦炎。
在平時，患者應保持高質量的睡眠，保持充足的水分攝入，保持營養均衡，并攝取足夠的維生素和礦物質。