一般情況下，心臟神經官能癥是一種植物神經調節紊亂所引起的功能性疾病，治療以對癥治療為主，具體內容如下：
心臟神經官能癥以心理治療為主，藥物治療為輔。無論心臟神經官能癥還是器質性心血管疾病合并精神心理問題者，都提倡針對心血管疾病和心理問題雙管齊下，即雙心醫學的治療模式。焦慮癥狀明顯的病人可選用抗焦慮藥物，如氯硝西泮、勞拉西泮等苯二氮草類抗焦慮藥。