瘧疾可能會死人，主要發生在重癥瘧疾，又沒有接受及時治療的患者。一般的間日瘧、三日瘧，以及卵形瘧等患者，只要早發現、早治療，且患者自身狀況較好的情況下，多數預后較好不會導致死亡。幼兒、年老體弱等特殊人群，或腦型瘧疾、惡性瘧疾等重癥病情，病情兇險、死亡率高，可能導致死亡。
間日瘧、三日瘧、卵形瘧患者經積極治療通常預后較好，三日瘧本身癥狀較輕，治愈后無復發現象，間日瘧和卵形瘧可能有復發可能，但一般病情未發展至嚴重程度不會引起死亡。上述三種類型的瘧疾遵醫囑應用氯喹、乙胺嘧啶片等藥物治療后，常能夠治愈不會導致死亡，日常生活中也應做好防護，避免蚊蟲叮咬等刺激復發。
惡性瘧疾臨床癥狀嚴重且病情兇險，可引起大量血紅蛋白尿導致腎損害，甚至引起腎功能衰竭。重癥患者可出現昏迷、重度貧血、肺水腫、急性呼吸窘迫綜合征，治療難度較大。同時，重癥患者還可能伴有黑尿熱、腦型瘧疾、腎臟或肝臟衰竭、脾臟破裂等并發癥，可能引起死亡，并且未經治療，或療效不佳者，以及發生在幼兒、年老體弱等特殊人群，死亡率相對較高。