雌二醇軟膏指雌二醇凝膠，雖然雌二醇凝膠和雌三醇軟膏都屬于雌激素，但是兩種藥物在成分、適應人群、不良反應等方面均有區別，需要在醫生的指導下使用藥物。
1、成分：雌二醇凝膠的主要成分是雌二醇，雌三醇軟膏的主要成分為雌三醇；
2、適應人群：雌二醇凝膠主要適用于絕經期綜合征出現的潮熱、出汗、煩躁等癥狀。雌三醇軟膏主要適用于雌激素缺乏，導致陰道干燥，以及下尿路萎縮的患者；
3、不良反應：雌二醇凝膠的不良反應主要有皮膚瘙癢、刺痛，還有全身不適癥狀，如頭痛、惡心、乳房脹痛等，但一般較少發生。雌三醇軟膏的不良反應除上述癥狀外，還有陰道灼燒感、陰道分泌物增加等癥狀；
4、其他：雌二醇的活性較高，在皮膚應用后，較容易被吸收進入血液，雌三醇一般不會被黏膜吸收。所以雌二醇凝膠長期使用后，不良反應的發生率會高于雌三醇軟膏，不建議長時間使用。