陰莖上面長紅色的痘痘可能是局部衛生不良、毛囊炎、皮脂腺囊腫、過敏反應、尖銳濕疣等因素所致，建議患者及時前往正規醫院就診檢查，在醫生的指導下選擇日常護理、藥物治療或手術治療的方式進行處理。
1、局部衛生不良：如果患者平時不注意個人衛生，陰莖部位清潔不到位，可能會導致局部污垢堆積，刺激皮膚出現紅色痘痘。一般無其他明顯伴隨癥狀。患者應注意保持局部清潔，每天用溫水清洗陰莖，勤換內褲。無需藥物和手術治療。
2、毛囊炎：毛囊炎是由細菌感染引起的，如金黃色葡萄球菌等。當陰莖部位的毛囊受到細菌感染時，會出現紅色痘痘，可能伴有疼痛、瘙癢等癥狀。患者可以在醫生的指導下使用阿莫西林膠囊、左氧氟沙星片、阿奇霉素片等藥物進行消炎治療。
3、皮脂腺囊腫：皮脂腺囊腫主要是由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊狀上皮被逐漸增多的內容物膨脹所形成的潴留性囊腫。陰莖部位的皮脂腺囊腫表現為紅色痘痘，一般無明顯疼痛或瘙癢，但如果發生感染，可能會出現紅腫、疼痛等癥狀。較小的皮脂腺囊腫一般無需治療，若囊腫較大或影響美觀，可以在醫生的指導下進行手術切除，如皮脂腺囊腫切除術等。
4、過敏反應：如果患者對內褲材質、避孕套、清潔劑等物質過敏，可能會引起陰莖部位的過敏反應，出現紅色痘痘，常伴有瘙癢、紅腫等癥狀。患者可以在醫生的指導下服用氯雷他定片、鹽酸西替利嗪片、馬來酸氯苯那敏片等抗過敏藥物。
5、尖銳濕疣：尖銳濕疣是由人乳頭瘤病毒（HPV）感染引起的性傳播疾病。陰莖上的尖銳濕疣表現為紅色痘痘，逐漸增大增多，呈菜花狀、乳頭狀等形狀，可能伴有瘙癢、疼痛等癥狀。尖銳濕疣一般需要進行手術治療，如激光手術、冷凍手術等，同時還可以在醫生的指導下使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊、干擾素α2b凝膠等藥物輔助治療。
患者在日常生活中應注意個人衛生，保持陰莖部位清潔干燥。飲食方面，應避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，可多吃新鮮的蔬菜和水果，如蘋果、香蕉、菠菜等。運動方面，可以適當進行一些有氧運動，如慢跑、游泳等，增強身體免疫力。