跖疣患者在局部抹上藥以后超級疼，可能是藥物刺激造成局部組織損傷所致，通常需要立即停藥，并在醫生指導下配合進行藥物治療、物理治療等。但部分患者出現此類情況，可能是外用藥物時誤傷周圍皮膚所致，需要對局部皮膚進行保護。
1、立即停藥：由于跖疣是人乳頭瘤病毒感染所導致的腳底部角質增厚性皮損，有一定傳染性，治療方法較多，包括外用藥物，以及激光冷凍、物理治療等不同方式。而外涂藥物治療通常是使用具有刺激性或腐蝕性的藥物，使跖疣局部的病變組織壞死、脫落達到治療效果，如外用冰醋酸、三氯醋酸溶液、水楊酸或氟尿嘧啶軟膏等，都有一定刺激性，在局部用藥后可能引起神經末梢受刺激，出現強烈疼痛感。雖然多數患者可以耐受此種疼痛，但少數患者比較敏感，疼痛特別明顯，因此需立即停藥，以避免藥物繼續刺激，停藥后需注意觀察，如果局部很快修復則影響不大；
2、藥物治療：如果外用藥物后局部已經發生破損，甚至存在繼發感染的可能，需局部外用碘伏、夫西地酸乳膏、莫匹羅星軟膏等藥物預防感染，并促進局部愈合。如果患者感覺到劇烈疼痛，也可以暫時性服用布洛芬緩釋膠囊、去痛片等止痛藥物；
3、物理治療：患者可以改用其他方式治療跖疣，如進行局部麻醉后，使用二氧化碳冷凍或激光燒灼等方式進行治療。由于操作過程中使用麻醉藥物后存在麻醉效果，患者的疼痛通常可以明顯減輕；
4、其他治療：有些跖疣患者在使用外用藥后出現劇烈疼痛，不一定是藥物的強烈刺激性所造成，而是用藥不當，未將藥物涂抹在跖疣增厚的皮損部位，藥物接觸到皮損周圍的正常皮膚，由于正常皮膚較薄嫩，因此在藥物刺激下特別容易受損，出現疼痛。此類患者可以先用橡皮膏等，在跖疣皮損周圍進行涂抹，以保護正常皮膚，再針對跖疣進行局部上藥，可能不會造成疼痛感。
存在跖疣的患者在平時需保證腳底衛生，保持腳部干燥。如果患者對治療跖疣的藥物過敏，而出現局部瘙癢、疼痛等癥狀，需立即停用藥物，也可以使用氯雷他定片、倍他司汀片等抗過敏藥物進行治療。