明目蒺藜丸和明目地黃丸的區別主要在于藥物成分、功效、治療病癥等不同。
1、藥物成分：明目蒺藜丸和明目地黃丸都屬于中成藥，兩者的藥物成分有所不同。明目蒺藜丸由黃連、旋復花、蒺藜、蔓荊子、密蒙花等組成。明目地黃丸由熟地黃、牡丹皮、山藥、白芍、茯苓、蒺藜等組成。
2、功效：由于兩種藥物的組成藥材不同，所以具有不同的功效。明目蒺藜丸具有清熱散風、明目退翳的功效。明目地黃丸具有滋腎、養肝、明目的功效。
3、治療病癥：明目蒺藜丸和明目地黃丸可用于治療不同的病癥，可以在醫生指導下根據具體病情選擇對應的藥物使用。明目蒺藜丸用于上焦火盛引起的迎風流淚、暴發火眼、眼邊赤爛等。明目地黃丸多用于目澀畏光、視物模糊、肝腎陰虛等。
除上述常見區別外，兩者的區別還有性狀、不良反應、禁忌人群等不同，日常出現不適癥狀后，要及時前往醫院就診。