全激光和全飛秒的主要區別在于操作方法，以及優缺點等方面。患者可根據病情的實際情況，在正規醫療機構進行檢查后選擇治療方法。另外，術后半年內要去醫院進行定期復查和用藥，促進病情恢復。
1、操作方法不同：全飛秒利用全飛秒激光器，通過飛秒激光進行操作，將角膜通過負壓環吸起進行切削，進而將角膜基質層切出一個透鏡后取出。全激光同時結合飛秒激光與準分子激光技術，先將角膜上皮和前彈力層消除，再將角膜基質層進行消融和切削，達到矯正近視和使角膜變薄的目的；
2、優缺點不同：兩種手術由于方式方法不同，所有優缺點也不同，全激光手術的切口比較小，切斷角膜神經比較少，很少會出現干眼的癥狀，相對而言更安全。而全飛秒手術對眼表神經影響相對較小，適合屈光不正的患者，可以個性化切削，對于部分患者會更有優勢。另外，全激光手術在操作時是要將激光對準眼睛，不需要使用刀或術者操作，只需要機器進行消融即可完成，過程比較流暢，而全飛秒手術過程需要兩臺機器共同完成。
無論采取何種術式，在術后患者均要注意健康用眼，不要長時間地看手機、電視等，用眼時間過久會造成視力疲勞，加重干眼的癥狀。還要注意飲食清淡，避免食用辛辣刺激性的食物，如辣椒、芥末等，恢復期間一旦出現眼部不適等問題，要及時去醫院就診。