只有一個指甲上有凹陷小坑可能是輕微外傷、營養不良、甲癬、銀屑病甲、扁平苔蘚甲等因素所致，建議患者及時前往正規醫院就診檢查，在醫生的指導下選擇日常護理、藥物治療的方式進行處理。
1、輕微外傷：指甲受到輕微的擠壓、碰撞等外傷，可能會導致指甲出現凹陷小坑。一般隨著指甲的生長，此種凹陷小坑會逐漸消失。無需特殊治療，注意保護指甲，避免再次受傷即可。
2、營養不良：缺乏某些營養素，如鐵、鋅、蛋白質等，可能會影響指甲的正常生長，導致指甲出現凹陷小坑。患者可能會同時伴有頭發干枯、皮膚干燥等癥狀。患者可以在醫生的指導下服用硫酸亞鐵片、葡萄糖酸鋅片、復合維生素片等藥物補充營養。
3、甲癬：甲癬是由皮膚癬菌等真菌感染引起的。真菌侵犯指甲，破壞指甲的結構，導致指甲出現凹陷、增厚、變色等癥狀。患者可以在醫生的指導下使用鹽酸阿莫羅芬搽劑、環吡酮胺乳膏、硝酸咪康唑乳膏等藥物進行抗真菌治療。
4、銀屑病甲：銀屑病累及指甲時，可出現凹陷小坑、頂針樣改變等癥狀。這是由于銀屑病導致指甲的角化異常所致。患者可以在醫生的指導下使用卡泊三醇軟膏、他扎羅汀凝膠、阿維A膠囊等藥物進行治療。
5、扁平苔蘚甲：扁平苔蘚累及指甲時，可出現指甲變薄、凹陷、縱嵴等癥狀。其原因是扁平苔蘚引起的炎癥反應影響了指甲的生長。患者可以在醫生的指導下使用糖皮質激素軟膏，如糠酸莫米松乳膏、鹵米松乳膏、丙酸氟替卡松乳膏等藥物進行治療。
此外，患者應該保持指甲清潔干燥，避免接觸刺激性物質。飲食上要注意營養均衡，適當吃富含蛋白質、維生素和礦物質的食物。