月經干凈通常指月經結束。一般情況下，查性激素六項不是月經結束后查，具體內容如下：
查性激素六項有助于明確女性的內分泌功能，而女性處于經期時，體內激素水平通常比較低，在月經來潮3-5天后進行性激素六項檢查，有助于了解卵巢的功能。因此，性激素六項檢測并不是月經結束后進行的。但是，如果女性月經周期不規律，通常可以在任意時間段進行檢查。在進行檢查前，女性應保持空腹狀態，以免對檢查結果產生影響。