卵圓孔未閉預后是比較不錯的，可以通過手術進行治療。
這種手術是一種很小的技術，而且很容易做，術后還會積極隨訪患者的情況。通過檢查發現，絕大多數的病人都在接受了卵圓孔未閉的封堵手術后，偏頭疼得到了緩解，而且還有一些高風險的腦梗死病人，在接受了卵圓孔未閉的手術后，并沒有發生腦梗死。因此，在正常情況下，如果需要做外科治療，在一年以內進行嚴密的追蹤治療，一般情況下，會有很好的恢復。