牙根腫脹鼓起可能由多種口腔疾病導致，比如急性牙周膿腫、急性根尖周膿腫、根尖周囊腫等，具體的發病原因不同，適合的治療方法以及吃的藥物也不盡相同，另外藥物還可能需要局部應用，而不僅僅是口服。
1、急性牙周膿腫：如果患牙的牙周袋較深，而且牙周袋迂回曲折，同時又沒有及時行科學規范化的牙周治療，牙周袋內就容易積存有較多的牙結石、牙菌斑。當患者抵抗力低下時，就有可能急性發作成為急性牙周膿腫，出現牙根腫脹鼓起，并且伴有疼痛癥狀。治療上需要將膿腫切開排盡膿液，然后去除牙周袋內的牙結石、牙菌斑，并使用生理鹽水、過氧化氫溶液行局部沖洗，還可在牙周袋內注射鹽酸米諾環素等藥物治療。此外，也可以遵醫囑內服甲硝唑片或者替硝唑片等藥物治療；
2、急性根尖周膿腫：急性化膿性根尖周炎發展加重到一定程度，會形成根尖膿腫，繼續發展就會突破牙槽骨，形成骨膜下膿腫，突破骨膜則形成黏膜下膿腫，使牙根腫脹鼓起，疼痛明顯，患牙松動度增加。治療上需要切開排膿引流，患牙需要調低咬合，打開牙髓腔，去除牙髓組織，擴通根尖孔引流。此外還可以遵醫囑服用阿莫西林膠囊、甲硝唑片等進行治療。待根尖炎癥消除后，可以行根管治療；
3、根尖周囊腫：大多是由于根尖肉芽腫、慢性炎癥的刺激，進而引起牙周膜內的上皮殘余增生，增生的上皮團中央發生變性液化，周圍組織液在局部不斷滲出積聚而形成。如果根尖的肉芽腫在拔牙后沒有做適當處理，殘留在局部也會形成根尖周囊腫。根尖周的囊腫體積增大到一定程度，會表現為牙根腫脹鼓起。手術是臨床上治療該病的主要方法，而非口服藥物。