早上起來咳嗽干嘔的原因通常包括飲食不當、胃腸型感冒、慢性咽炎、反流性食管炎、肺炎等，建議患者及時去醫院檢查，盡早查明病因。
1、飲食不當：若患者在睡覺前食用過多辛辣刺激性的食物，容易對咽喉黏膜產生刺激，讓患者早上起床后出現咳嗽、干嘔的情況。患者可以喝一些溫熱水，可以滋潤咽喉，緩解不適癥狀。
2、胃腸型感冒：胃腸型感冒通常是指普通感冒引起的胃腸功能紊亂，患者早起后可能會出現咳嗽、惡心、干嘔、腹瀉、發熱等癥狀。建議患者遵醫囑使用氨酚偽麻那敏顆粒、感冒靈顆粒、連花清瘟膠囊等藥物來治療，可以促使病情恢復。
3、慢性咽炎：慢性咽炎是指咽部黏膜、黏膜下及淋巴組織的慢性炎癥，患者通常會出現異物感、咽干、咽痛等癥狀，早上起床后咽喉比較干燥，就可能會出現咳嗽、干嘔的癥狀。建議遵醫囑使用銀黃含片、桂林西瓜霜含片、西地碘含片等藥物來治療，可以起到清熱解毒、消腫止痛的作用。
4、反流性食管炎：反流性食管炎是因酸（堿）反流導致的食管黏膜破損，患者睡覺時胃內容物可能會反流到咽喉，對其產生刺激，引起干嘔、咳嗽的癥狀，還會伴隨燒心、上腹痛、噯氣等癥狀。建議患者遵醫囑使用多潘立酮片、蘭索拉唑腸溶片、奧美拉唑腸溶膠囊等藥物來治療，可以起到促進胃動力，抑制胃酸分泌的作用。
5、肺炎：肺炎通常是指肺泡、遠端氣道和肺間質的感染性炎癥，會出現發熱、咳嗽、咳痰等癥狀，病情嚴重時還有可能影響消化系統，使患者起床后出現干嘔的癥狀。需要遵醫囑使用羅紅霉素膠囊、鹽酸左氧氟沙星膠囊、頭孢克肟分散片等藥物來治療，有助于減輕炎癥，促進病情恢復。
患者平時要注意休息，適當添加衣物，做好保暖措施，避免受涼。