新冠疫苗通常是指新型冠狀病毒疫苗，在藥理作用上，新型冠狀病毒疫苗與頭孢克肟并不會互相產生抗體。但用藥期間是否能夠接種疫苗，或者是接種疫苗后能否使用頭孢克肟，還與受種者的健康狀況有關。
新型冠狀病毒疫苗可以預防新型冠狀病毒感染，臨床上常用的新型冠狀病毒疫苗主要有新型冠狀病毒減毒活疫苗、新型冠狀病毒滅活疫苗，以及基因重組蛋白疫苗。而頭孢克肟屬于第三代頭孢類抗生素，該藥物抗菌譜廣，經口服給藥后，可以治療敏感的革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌所致的感染，包括淋病、呼吸道感染和泌尿道感染。在藥物作用機理上，新型冠狀病毒疫苗與頭孢克肟通常不會產生抗體，頭孢克肟屬于抗生素，主要是針對細菌起作用，而新型冠狀病毒疫苗屬于病毒疫苗，二者之間沒有明顯配伍禁忌，也就是新型冠狀病毒疫苗與頭孢克肟同時使用，并不會出現嚴重的過敏反應，也不會引起明顯的肝腎毒性，通常可以同時安全使用。
但需要注意的是，新型冠狀病毒疫苗屬于外來抗原，可以刺激機體產生不良反應，主要為急性過敏反應，如果接種劑型為注射劑還可能會引起接種部位皮膚的硬結、瘙癢、紅腫，或者是引起一過性發熱。如果此時口服頭孢克肟，也可以引起一定過敏反應，兩者常相互疊加，可能會出現比較明顯的過敏反應，而且兩者共同應用后出現不良反應時，可能無法判斷到底為接種疫苗所致，還是使用藥物引起，不利于進行鑒別及后續處理。
因此，接種新型冠狀病毒疫苗后頭三天內盡量不要吃頭孢克肟，一周后若新型冠狀病毒疫苗已經完全吸收，產生了特異性新型冠狀病毒抗體，才能服用頭孢克肟。如果接種新型冠狀病毒疫苗前，已經存在體內各部位感染，需要使用頭孢克肟消炎治療，此時建議延緩接種新型冠狀病毒疫苗。如果受種者近期長時間使用頭孢克肟，需咨詢醫生接種疫苗前后是否停藥，并遵醫囑選擇合適疫苗接種的時間。